Medir las variables de las aguas superficiales, aguas subterráneas y la calidad del agua con la frecuencia adecuada, asegurando la continuidad en donde ya se mide e incrementando la cobertura en sitios prioritarios del país, con el objeto de administrar y preservar de una manera eficiente las aguas nacionales.

Puntos de medición de aguas superficiales automáticos:1,968
Puntos de medición de aguas subterráneas manuales: 21,885
Puntos de medición de aguas subterráneas automáticos: 1,000
Puntos de medición de calidad del agua manuales: 5,752
Puntos de medición de calidad del agua automáticos: 56
Centro de comando y control: 1

La infraestructura para medición de las aguas superficiales consiste en equipos automáticos. Se contemplan estaciones automáticas para la medición de variables climatológicas, niveles y caudales en las principales cuencas, ríos y presas del país.

La infraestructura para medición considera:
- Medición manual de una red de monitoreo piezométrico que consiste en llevar a cabo mediciones de la profundidad y elevación del nivel de las aguas subterráneas en forma periódica en pozos piloto que integran las redes, a fin de obtener la evolución de los niveles de agua subterránea con el tiempo.
- Las sondas automáticas se proponen para la medición y registro continuos de las variaciones del nivel de las aguas subterráneas (nivel piezométrico) al interior de un pozo, que se encuentre abandonado y sin equipo de bombeo. La sonda automática está diseñada para medir y registrar dos parámetros: la temperatura del agua subterránea y la carga hidráulica (presión atmosférica más tirante de agua) a la profundidad de instalación.
- Medición manual instantánea, la cual considera la toma de muestra, determinación de parámetros de campo y análisis en laboratorio. El número promedio de determinaciones analíticas es de aproximadamente 40 pudiendo llegar a más de 250 en el caso de Estudios Especiales.
- Medición automática con sensores en línea. A través de este tipo de medición es posible obtener resultados de manera inmediata, los cuales permiten la implementación de acciones eficaces.